在1866年，海里出现了海怪，阿龙纳斯教授受美国海军邀请，参加捕捉“海怪”行动，但在捕捉“海怪”时不慎和仆人康赛尔以及“林肯号”上的鱼叉手尼德落水，被“海怪”的船长尼摩救下。
尼摩船长救下阿龙纳斯一行人后，介绍了这艘潜水艇的功能，并邀请阿龙纳斯跟随他们来一场海底旅行。
等到第二天正午，尼摩船长带阿龙纳斯一行人和一个船员，去海底森林打猎，打猎行动结束后，大家都很愉快。
之后，“诺第留斯”号来到了托雷斯海峡，但却在波罗尔岛上搁浅，还遇见了野人，令阿龙纳斯惊恐万分，但尼摩船长凭借着船上的高科技，击退了野人。
第二年的一月二十六日，“诺第留斯”号来到了斯里兰卡岛，尼摩船长带着阿龙纳斯三人去采珠场，在鲨鱼口中救下一名采珠人，并在二月八日到了亚丁湾，在亚丁湾发现了海底宝藏。尼摩船长把宝藏换成钱，捐给了混乱地区的人们，打消尼德和我的顾虑。
三月初，尼摩船长带着阿龙纳斯他们，来到了南极，撞破二十多块冰障，最终用船上的冲角冲破了冰层，浮上了海面，阿龙纳斯教授跟随着尼摩船长的脚步，登上了南极大陆。
五月初，尼摩船长发现了一艘军舰，军舰的炮弹打在潜水艇上，尼摩船长一下认出了军舰上的国籍，十分愤怒，其他船员也十分生气，尼摩船长开足了马力，朝军舰撞去，“诺第留斯”号的冲角攻击了军舰的船身，军舰沉没了。
尼德认为这个时候是逃跑的好机会，于是带着阿龙纳斯教授和康赛尔上了救生艇，但“诺第留斯”号卷进了漩涡，幸运的是阿龙纳斯一行人被冲到一个小岛岸上，被人救了下来。
